Protein–RNA interactions for Protein: Q6GYQ0

RALGAPA1, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 2,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA1Q6GYQ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RALGAPA1Q6GYQ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RALGAPA1Q6GYQ0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RALGAPA1Q6GYQ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RALGAPA1Q6GYQ0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms