Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATL3Q6DD88 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATL3Q6DD88 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATL3Q6DD88 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATL3Q6DD88 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ATL3Q6DD88 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 320.8 ms