Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ANKRD40Q6AI12 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ANKRD40Q6AI12 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ANKRD40Q6AI12 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ANKRD40Q6AI12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms