Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LHX8Q68G74 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LHX8Q68G74 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LHX8Q68G74 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LHX8Q68G74 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms