Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALS2CLQ60I27 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
ALS2CLQ60I27 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2CLQ60I27 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms