Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ECM29Q5VYK3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ECM29Q5VYK3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ECM29Q5VYK3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ECM29Q5VYK3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms