Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.21
CHIC1Q5VXU3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC41.32■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC41.27■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CHIC1Q5VXU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC41.22■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
CHIC1Q5VXU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.18
CHIC1Q5VXU3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC41.09■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CHIC1Q5VXU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CHIC1Q5VXU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms