Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAF3Q5VWG9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAF3Q5VWG9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAF3Q5VWG9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TAF3Q5VWG9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms