Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EEF1A1P5Q5VTE0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EEF1A1P5Q5VTE0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EEF1A1P5Q5VTE0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms