Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIF1Q5UIP0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIF1Q5UIP0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIF1Q5UIP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIF1Q5UIP0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms