Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM164Q5U3C3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM164Q5U3C3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM164Q5U3C3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM164Q5U3C3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms