Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9S5

CCDC18, Coiled-coil domain-containing protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 1,454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18Q5T9S5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
CCDC18Q5T9S5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CCDC18Q5T9S5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CCDC18Q5T9S5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
CCDC18Q5T9S5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CCDC18Q5T9S5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms