Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CELF3Q5SZQ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CELF3Q5SZQ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CELF3Q5SZQ8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CELF3Q5SZQ8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms