Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHYHD1Q5SRE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PHYHD1Q5SRE7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PHYHD1Q5SRE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PHYHD1Q5SRE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms