Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGT7

RTP2, Receptor-transporting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP2Q5QGT7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP2Q5QGT7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP2Q5QGT7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RTP2Q5QGT7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RTP2Q5QGT7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RTP2Q5QGT7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP2Q5QGT7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms