Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ODF2Q5BJF6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ODF2Q5BJF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ODF2Q5BJF6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms