Protein–RNA interactions for Protein: Q562R1

ACTBL2, Beta-actin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBL2Q562R1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ACTBL2Q562R1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ACTBL2Q562R1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ACTBL2Q562R1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms