Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF394Q53GI3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF394Q53GI3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF394Q53GI3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF394Q53GI3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms