Protein–RNA interactions for Protein: Q502W6

VWA3B, von Willebrand factor A domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3BQ502W6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VWA3BQ502W6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VWA3BQ502W6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VWA3BQ502W6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VWA3BQ502W6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms