Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SYTL3Q4VX76 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SYTL3Q4VX76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SYTL3Q4VX76 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms