Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CFAP221Q4G0U5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CFAP221Q4G0U5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CFAP221Q4G0U5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CFAP221Q4G0U5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms