Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N8

SLC9C1, Sodium/hydrogen exchanger 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9C1Q4G0N8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SLC9C1Q4G0N8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC9C1Q4G0N8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC9C1Q4G0N8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC9C1Q4G0N8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms