Protein–RNA interactions for Protein: Q49AG3

ZBED5, Zinc finger BED domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED5Q49AG3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED5Q49AG3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED5Q49AG3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED5Q49AG3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED5Q49AG3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED5Q49AG3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZBED5Q49AG3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZBED5Q49AG3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms