Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CFAP100Q494V2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CFAP100Q494V2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CFAP100Q494V2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CFAP100Q494V2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms