Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC25A52Q3SY17 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC25A52Q3SY17 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC25A52Q3SY17 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC25A52Q3SY17 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms