Protein–RNA interactions for Protein: Q33E94

RFX4, Transcription factor RFX4, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX4Q33E94 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RFX4Q33E94 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RFX4Q33E94 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RFX4Q33E94 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RFX4Q33E94 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms