Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTC1Q2NKJ3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CTC1Q2NKJ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CTC1Q2NKJ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTC1Q2NKJ3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms