Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SPHKAPQ2M3C7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SPHKAPQ2M3C7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
SPHKAPQ2M3C7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SPHKAPQ2M3C7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SPHKAPQ2M3C7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms