Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIDA1Q1XH10 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIDA1Q1XH10 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIDA1Q1XH10 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
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