Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRNQ16849 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTPRNQ16849 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPRNQ16849 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
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