Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RTN1Q16799 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RTN1Q16799 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RTN1Q16799 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RTN1Q16799 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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