Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDKN3Q16667 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDKN3Q16667 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDKN3Q16667 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDKN3Q16667 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms