Protein–RNA interactions for Protein: Q16663

CCL15, C-C motif chemokine 15, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL15Q16663 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CCL15Q16663 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCL15Q16663 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCL15Q16663 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCL15Q16663 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms