Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
HLFQ16534 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HLFQ16534 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HLFQ16534 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HLFQ16534 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
HLFQ16534 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HLFQ16534 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HLFQ16534 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HLFQ16534 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HLFQ16534 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HLFQ16534 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HLFQ16534 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HLFQ16534 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HLFQ16534 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HLFQ16534 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HLFQ16534 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HLFQ16534 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HLFQ16534 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
HLFQ16534 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HLFQ16534 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HLFQ16534 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HLFQ16534 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HLFQ16534 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HLFQ16534 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HLFQ16534 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HLFQ16534 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HLFQ16534 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HLFQ16534 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HLFQ16534 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HLFQ16534 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HLFQ16534 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HLFQ16534 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HLFQ16534 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HLFQ16534 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HLFQ16534 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HLFQ16534 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HLFQ16534 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HLFQ16534 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HLFQ16534 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HLFQ16534 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HLFQ16534 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HLFQ16534 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HLFQ16534 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HLFQ16534 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HLFQ16534 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HLFQ16534 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HLFQ16534 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HLFQ16534 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HLFQ16534 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HLFQ16534 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HLFQ16534 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HLFQ16534 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HLFQ16534 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HLFQ16534 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HLFQ16534 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HLFQ16534 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HLFQ16534 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
HLFQ16534 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HLFQ16534 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
HLFQ16534 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HLFQ16534 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
HLFQ16534 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
HLFQ16534 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
HLFQ16534 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HLFQ16534 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
HLFQ16534 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
HLFQ16534 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
HLFQ16534 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
HLFQ16534 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
HLFQ16534 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
HLFQ16534 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
HLFQ16534 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HLFQ16534 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
HLFQ16534 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLFQ16534 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLFQ16534 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLFQ16534 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLFQ16534 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
HLFQ16534 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLFQ16534 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
HLFQ16534 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HLFQ16534 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HLFQ16534 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
HLFQ16534 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
HLFQ16534 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HLFQ16534 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HLFQ16534 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HLFQ16534 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
HLFQ16534 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
HLFQ16534 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HLFQ16534 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HLFQ16534 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HLFQ16534 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
HLFQ16534 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HLFQ16534 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HLFQ16534 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
HLFQ16534 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
HLFQ16534 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HLFQ16534 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
HLFQ16534 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms