Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6AP1Q15904 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATP6AP1Q15904 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATP6AP1Q15904 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms