Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPS6KA1Q15418 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RPS6KA1Q15418 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPS6KA1Q15418 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms