Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLR1Q15399 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLR1Q15399 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TLR1Q15399 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLR1Q15399 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms