Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB39AQ14964 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
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RAB39AQ14964 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB39AQ14964 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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RAB39AQ14964 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
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RAB39AQ14964 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RAB39AQ14964 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
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