Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
IRF3Q14653 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IRF3Q14653 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IRF3Q14653 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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