Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NID2Q14112 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NID2Q14112 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NID2Q14112 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NID2Q14112 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NID2Q14112 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NID2Q14112 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NID2Q14112 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NID2Q14112 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NID2Q14112 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NID2Q14112 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NID2Q14112 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NID2Q14112 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NID2Q14112 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NID2Q14112 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NID2Q14112 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NID2Q14112 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NID2Q14112 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NID2Q14112 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NID2Q14112 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NID2Q14112 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NID2Q14112 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NID2Q14112 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NID2Q14112 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NID2Q14112 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NID2Q14112 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NID2Q14112 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NID2Q14112 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NID2Q14112 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NID2Q14112 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NID2Q14112 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NID2Q14112 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NID2Q14112 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NID2Q14112 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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NID2Q14112 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NID2Q14112 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NID2Q14112 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NID2Q14112 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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NID2Q14112 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NID2Q14112 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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NID2Q14112 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NID2Q14112 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NID2Q14112 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NID2Q14112 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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NID2Q14112 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NID2Q14112 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NID2Q14112 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NID2Q14112 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NID2Q14112 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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NID2Q14112 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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NID2Q14112 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
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NID2Q14112 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
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NID2Q14112 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NID2Q14112 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NID2Q14112 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NID2Q14112 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NID2Q14112 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NID2Q14112 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NID2Q14112 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NID2Q14112 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NID2Q14112 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NID2Q14112 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NID2Q14112 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NID2Q14112 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NID2Q14112 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NID2Q14112 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NID2Q14112 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NID2Q14112 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NID2Q14112 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NID2Q14112 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NID2Q14112 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NID2Q14112 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NID2Q14112 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NID2Q14112 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NID2Q14112 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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