Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP1A4Q13733 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP1A4Q13733 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATP1A4Q13733 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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