Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CACNA1SQ13698 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
CACNA1SQ13698 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CACNA1SQ13698 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CACNA1SQ13698 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CACNA1SQ13698 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
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