Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FHL3Q13643 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FHL3Q13643 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
FHL3Q13643 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
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