Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
IRF5Q13568 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
IRF5Q13568 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IRF5Q13568 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IRF5Q13568 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
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