Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PMS2P3Q13401 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
PMS2P3Q13401 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PMS2P3Q13401 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PMS2P3Q13401 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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