Protein–RNA interactions for Protein: Q13330

MTA1, Metastasis-associated protein MTA1, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1Q13330 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTA1Q13330 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTA1Q13330 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MTA1Q13330 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms