Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAA1Q13131 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRKAA1Q13131 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRKAA1Q13131 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PRKAA1Q13131 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
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