Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CHAF1BQ13112 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHAF1BQ13112 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHAF1BQ13112 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
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