Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRAF2Q12933 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAF2Q12933 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAF2Q12933 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms