Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPN13Q12923 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPN13Q12923 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPN13Q12923 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPN13Q12923 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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